Frederik blev gift med Birgitte Andersdatter Hauberg den 4 feb. 1843 i Mesing Sogn (Mesing Kirke), Hjelmslev Herred, Skanderborg Amt. Birgitte (datter af Anders Terkelsen (Hauberg) og Frederike Lovise Frederichsdatter) blev født den 11 nov. 1819 i Hornborg Sogn (Hornborg), Nim Herred, Skanderborg Amt; blev døbt den 16 jan. 1820 i Hornborg Sogn (Hornborg Kirke), Nim Herred, Skanderborg Amt; og døde. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Christen Frederiksen blev født den 12 maj 1843 i Harlev sogn (Tåstrup), Framlev herred, Århus amt; blev døbt den 13 aug. 1843 i Harlev sogn (Gammel Harlev Kirke), Framlev herred, Århus amt; og døde.
2. Anders Haubjerg Frederiksen blev født den 26 mar. 1845 i Harlev sogn (Tåstrup), Framlev herred, Århus amt; blev døbt den 27 apr. 1845 i Harlev sogn (Gammel Harlev Kirke), Framlev herred, Århus amt; og døde.
3. Frederik Ludvig Frederiksen blev født den 21 jun. 1850 i Harlev sogn (Tåstrup), Framlev herred, Århus amt; blev døbt den 11 aug. 1850 i Harlev sogn (Gammel Harlev Kirke), Framlev herred, Århus amt; og døde.
4. Knud Engelbrecht Frederiksen blev født den 14 jun. 1852 i Låsby sogn (Flensted), Gjern herred, Skanderborg amt; blev døbt den 24 okt. 1852 i Låsby sogn (Låsby Kirke), Gjern herred, Skanderborg amt; og døde.
5. Therkel Hauberg Frederiksen blev født den 29 mar. 1854 i Låsby sogn (Flensted), Gjern herred, Skanderborg amt; blev døbt den 2 jul. 1854 i Låsby sogn (Låsby Kirke), Gjern herred, Skanderborg amt; og døde.
6. Anne Kirstine Lovise Frederiksen blev født den 13 nov. 1857 i Låsby sogn (Flensted), Gjern herred, Skanderborg amt; blev døbt den 28 feb. 1858 i Låsby sogn (Låsby Kirke), Gjern herred, Skanderborg amt; og døde.